Documentation de l’algorithme d’orientation Covid-19

Version: 2020-06-09

Introduction et contexte

Ce dépôt contient une présentation de l’algorithme d’orientation Covid-19 officiellement publié par le ministère des Solidarités et de la Santé.

L’algorithme est défini par un comité scientifique, appelé CovidTélé, réunissant des médecins et co-piloté par l’AP-HP et l’Institut Pasteur.

Afin que toutes les initiatives qui participent à la gestion de la crise sanitaire s’appuient sur les mêmes recommendations, le ministère des Solidarités et de la Santé conseille la réutilisation de cet algorithme.

Voir le site d’information générale produit à partir de ce dépôt.

Présentation générale de la documentation

Dans ce dépôt, il faut bien distinguer plusieurs éléments :

• le questionnaire, composé des questions possibles et des réponses possibles pour chaque question ;
• le parcours, qui est une version ordonnée du questionnaire
• les données saisies par l’utilisateurs (par exemple l’âge) ;
• les données calculées à partir des données saisies (par exemple la tranche d’âge) ;
• l’algorithme, qui est le calcul sur les données saisies et calculées déterminant le message d’orientation.

Le questionnaire propose un parcours utilisateur qui permet de recevoir des informations (les données saisies), d’en déduire des valeurs intermédiaires (les données calculées) et de proposer un message d’orientation, calculé à la fois à partir des valeurs saisies et des valeurs intermédiaires.

Ces éléments donnent lieu à plusieurs présentations:

• Le document officiel présente le questionnaire et l’algorithme de façon linéaire et synthétique.
• La page d’implémentation donne des détails sur les données saisies, les données calculées et leur sauvegarde pour partage.
• La page de pseudo-code présente le questionnaire, le parcours et l’algorithme de façon analytique.

Document officiel

Le document officiel de l’algorithme d’orientation Covid-19 est publié par le ministère des Solidarités et de la Santé. Il est lisible en ligne et téléchargeable ici.

Référencement

Toutes les applications d’information, d’orientation et de triage qui réutilisent cet algorithme sont référencées sur le site du ministère des Solidarités et de la Santé.

Si vous implémentez cet algorithme et souhaitez partager vos données, renseignez ce formulaire en ligne ou écrivez-nous à l’adresse [email protected] pour que votre initiative soit référencée sur le site du ministère des Solidarité et de la Santé.

Toute implémentation référencée doit impérativement :

1. respecter l’algorithme d’orientation Covid-19 ;
2. utiliser le schéma de données officiel ;
3. et suivre les recommandations d’implémentation.

Pour savoir si les données csv que vous produisez sont correctes, vous pouvez utiliser cet outil de validation.

Ce que contient ce dépôt

• un guide pour aider à l’évaluation des implémentations ;
• une présentation des éléments formels de l’algorithme à respecter ;
• des recommandations pour le référencement de votre application ;
• des recommandations pour l’implémentation de l’algorithme ;
• des exemples d’implémentation et de mise en oeuvre d’une API ;
• une validation formelle de l’algorithme.

Et aussi :

• le code source du démonstrateur de l’algorithme ;
• les instructions à destination des développeurs de ce dépôt.

Contribuer

Les contributions sont les bienvenues, sous forme d’issues ou de pull requests.

Remerciements

Merci à Denis Merigoux pour la contribution de la preuve formelle.

Merci à Simon Chignard pour ses conseils sur la contextualisation des informations concernant cette documentation.

Merci à Jean-Matthieu Schertzer d’être intervenu pour signaler un problème. Vous pouvez utilement consulter l’article de blog qu’il consacre à une version simplifiée de l’algorithme de décision et à une comparaison entre l’approche par arbre de décision et l’approche par système de points, toutes deux logiquement équivalentes.

Licence

2020 Délégation ministérielle du numérique en santé et les contributeurs du dépôt.

Le code source de ce dépôt est publié sous licence EPL-2.0.

Le contenu du document de présentation de l’algorithme est publié sous licence Ouverte 2.0.